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Publications et thèses de 2012

Publications :

1. Gas-phase basicities of polyfunctional molecules. Part 2 : Saturated basic sites.
- G. Bouchoux, J.-Y. Salpin
- Mass Spectrom. Rev., 31(3), 353-390, 2012

2. Modelling peptide-metal dication interactions : Formamide-Ca2+ reactions in the gas phase.
- A. Eizaguirre, O. Mó, M. Yáñez, J.-Y. Salpin, J. Tortajada
- Org. Biomol. Chem. 10(37) 11752-11761, 2012

3. How can f-block monocations behave as d-block transition metals ?
- A. Quemet, R. Brennetot, J.-Y. Salpin, A. Cimas, C. Marsden, J. Tortajada, P. Vitorge
- Eur. J. Inorg. Chem., 2012(22), 3551-3555, 2012

4. Collision Induced Dissociation of doubly-charged ions : Coulomb explosion vs neutral loss in [Ca(urea)]2+ gas phase unimolecular reactivity via chemical dynamics simulations.
- R. Spezia, A. Cimas, M.-P. Gaigeot, J.-Y. Salpin, K. Song, W.L. Hase
- Phys. Chem. Chem. Phys., 14(33), 11724-11736, 2012

5. Critical parameters for the analysis of anionic oligosaccharides by desorption electrospray ionization (DESI) mass spectrometry.
- C. Przybylski, F. Gonnet, W. Buchmann, R. Daniel
- J. Mass Spectrom., 47(8), 1047-1058, 2012

6. Desorption electrospray ionization - orbitrap mass spectrometry of synthetic polymers and copolymers.
- M. Friia, V. Legros, J. Tortajada, W. Buchmann
- J. Mass Spectrom., 47(8), 1023-1033, 2012

7. Production of functional full-length recombinant human C1q.
- I. Bally, S. Ancelet, C. Moriscot, F. Gonnet, R. Daniel, G. Schoehn, G.J. Arlaud, N. Thielens
- Immunobiology, 217(11), 1194, 2012

8. The interactome of the amyloid precursor protein APP in brain reveals a protein network involved in synaptic vesicle turnover and a close association with synaptotagmin1.
- B.M. Kohli, D. Pflieger, L.N. Mueller, G. Carbonetti, R. Aebersold, R.M. Nitsch, U. Konietzko
- J. Proteome Res., 11(8), 4075-4090, 2012

9. Automated phosphopeptide identification using multiple MS/MS fragmentation modes.
- M. Vandenbogaert, V. Hourdel, O. Jardin-Mathé, J. Bigeard, L. Bonhomme, V. Legros, H. Hirt, B. Schwikowski, D. Pflieger
- J. Proteome Res., 11(12), 5695-703, 2012

10. Further insight into the detailed characterization of a polydisperse cyclodextrin-based polyrotaxane sample by electrospray ionization mass spectrometry.
- C. Przybylski, V. Bonnet, N. Jarroux
- ACS Macro lett., 1(5), 533–536, 2012

11. Single molecule detection of glycosaminoglycan hyaluronic acid oligosaccharides and depolymerization enzyme activity using a protein nanopore.
- A. Fennouri, C. Przybylski, M. Pastoriza-Gallego, L. Bacri, L. Auvray, R. Daniel
- ACS Nano, 6(11), 9672-9678, 2012

12. Understanding the mechanism of short-range electron transfer using an immobilized cupredoxin.
- S. Monari, G. Battistuzzi, C.A. Bortolotti, S. Yanagisawa, K. Sato, C. Li, I. Salard, D. Krostrz, M. Borsari, A. Ranieri, C. Dennison, M. Sola
- J. Am. Chem. Soc., 134(29), 11848-11851, 2012

13. Charge localization in multiply charged clusters and their electrical properties : Some insights into electrospray droplets.
- D.A. Bonhommeau, R. Spezia, M.-P. Gaigeot
- J. Chem. Phys., 136(18), 184503-10, 2012

14. Liquid-solid interfaces : structure and dynamics from spectroscopy and simulations PREFACE.
- M.-P. Gaigeot, M. Sulpizi
- J. Phys.-Condens. Mat., 24(12), 120301-2, 2012

15. Oxide/water interfaces : how the surface chemistry modifies interfacial water properties.
- M.-P. Gaigeot, M. Sprik, M. Sulpizi
- J. Phys.-Condens. Mat., 24(12), 124106, 2012

16. The Silica-Water interface : How the silanols determine the surface acidity and modulate the water properties.
- M. Sulpizi, M.-P. Gaigeot, M. Sprik
- J. Chem. Theory Comput., 8(3), 1037-1047, 2012

17. Improving anharmonic infrared spectra using semiclassically prepared molecular dynamics simulations.
- N.T. Van-Oanh, C. Falvo, F. Calvo, D. Lauvergnat, M. Basire, M.-P. Gaigeot, P. Parneix Phys. Chem. Chem. Phys., 14(7), 2381-2390, 2012

18. Unravelling the hydration structure of ThX4 (X = Br, Cl) water solutions by Molecular Dynamics Simulations and X-ray Absorption Spectroscopy.
- R. Spezia, C. Beuchat, R. Vuilleumier, P. D’Angelo, L. Gagliardi
- J. Phys. Chem. B, 116(22), 6465-6475, 2012

19. Phosphorylation controls the interaction of the Connexin43 C-terminal domain with tubulin and microtubules.
- A.S. Brikci-Nigassa, M.-J. Clement, T. Ha-Duong, E. Adjadj, L. Ziani, D. Pastre, P.A. Curmi, P. Savarin
- Biochemistry, 51(21), 4331-4342, 2012

20. Molecular Density Functional Theory : Application to solvation and electron-transfer thermodynamics in polar solvents.
- D. Borgis, L. Gendre, R. Ramirez
- J. Phys. Chem. B, 116(8), 2504-2512, 2012

21. Hydration of Lanthanoids(III) and Actinoids(III) : a theoretical/experimental saga.
- P. D’Angelo, R. Spezia
- Chem. Eur. J., 18(36), 11162-11178, 2012

22. Electronic structure and bonding of lanthanoid(III) carbonates.
- Y. Jeanvoine, P. Miro, F. Martelli, C.J. Cramer, R. Spezia
- Phys. Chem. Chem. Phys., 14(43), 14822-14831, 2012

23. Varying the charge of small cations in liquid water : Structural, transport and thermodynamical properties.
- F. Martelli, R. Vuilleumier, J.-P. Simonin, R. Spezia
- J. Chem. Phys., 137(16), 164501, 2012

24. Structure and stability of charged clusters.
- M.A. Miller, D.A. Bonhommeau, C.J. Heard, Y. Shin, R. Spezia, M.-P. Gaigeot
- J. Phys.-Cond. Matter., 24(28), 284130, 2012

25. AIMD of the AlOOH boehmite/water interface : role of steps in interfacial Grotthus proton transfers.
- A. Motta, M.-P. Gaigeot, D. Costa
- J. Phys. Chem. C, 116(23), 12514-12514, 2012

26. AIMD evidence of inner sphere adsorption of glycine on a stepped AlOOH surface.
- A. Motta, M.-P. Gaigeot, D. Costa
- J. Phys. Chem. C, 116(44), 23418-23427, 2012

27. Liquid water ionization by fast electron impact : a multiple differential study for the 1B(1) orbital.
- M.L de Sanctis, M.-F. Politis, R. Vuilleumier, C.R. Stia, O.A. Fojon
- J. Phys. B : At. Mol. Opt. Phys., 45(4), 045206, 2012

28. La spéciation en toxicologie.
- C. Bresson, F. Chartier, E. Ansoborlo
- L’Actualité Chimique, 367-368, 2012

29. A computational study of the reaction of P+ with acetylene : does spin-crossing play a significant role ?
- A. Cimas, V.M. Rayón, A. Largo
- J. Phys. Chem. A, 116(11), 3014-3022, 2012

30. An energetic study applied to the knowledge of the structural and electronic properties of monofluorobenzonitriles.
- M.A.V. Ribeiro da Silva, M.J. Monte, I.M. Rocha, A. Cimas
- J. Org. Chem., 77(9), 4312-4322, 2012

31. Kinetics of oxidation and dissolution of uranium dioxide in aqueous acid solutions.
- C. Gaulard-Balandret, N. Larabi-Gruet, F. Miserque, J. Radwan, C. Ferry, A. Chaussé
- Electrochim. Acta, 83, 471-477, 2012

32. Microbial catalysis of the oxygen reduction reaction for microbial fuel cells : A review.
- B. Erable, D. Féron, A. Bergel
- Chemsuschem., 5(6), 975-987, 2012

33. Hydrogen trapping by VC precipitates and structural defects in a high strength Fe-Mn-C steel studied by small-angle neutron scattering.
- B. Malard, B. Remy, C. Scott, A. Deschamps, J. Chêne, T. Dieudonne, M.H. Mathon
- Mat. Sci. Eng. A-Struct., 536, 110-116, 2012

34. Gene transfer by chemical vectors, and endocytosis routes of polyplexes, lipoplexes and lipopolyplexes in a myoblast cell line.
- L. Billiet, J.-P. Gomez, M. Berchel, P.-A. Jaffres, T. Le Gall, T. Montier, E. Bertrand, H. Cheradame, P. Guégan, M. Mevel, B. Pitard, T. Benvegnu, P. Lehn, C. Pichon, P. Midoux
- Biomaterials, 33(10), 2980-2990, 2012

35. Trans-endothelial passage of chemical vectors in a skeletal muscle endothelium model : Effect of inflammatory cytokines.
- J.-P. Gomez, P.-A. Jaffres, H. Cheradame, P. Guégan, B. Pitard, P. Lehn, C. Pichon, P. Midoux
- Hum. Gene Ther., 23(10), A140-A140, 2012

36. PTG1.L, a new powerful reagent for the production of recombinant lentiviral vectors.
- F. Gross, P. Guégan, H. Cheradame, P. Midoux
- Hum. Gene Ther., 23(10), A148-A148, 2012

37. Strengthening of degraded cellulosic material using a diamine alkylalkoxysilane.
- Z. Souguir, A.-L. Dupont, K. Fatyeyeva, G. Mortha, H. Cheradame, S. Ipert, B. Lavedrine
- RSC Advances, 2(19), 7470-7478, 2012

38. Reinforcement properties of 3-aminopropylmethyldiethoxysilane and N-(2-Aminoethyl)-3-aminopropylmethyldimethoxysilane on polyurethane ester foam.
- E. Pellizzi, A. Lattuati-Derieux, J.-B.D. de Lacaillerie, B. Lavedrine, H. Cheradame
- Polym. Degrad. Stabil., 97(11), 2340-2346, 2012

39. Synthesis of Poly(2-methyl-2-oxazoline) star polymers with a béta-cyclodextrin core.
- G. Pereira, C. Huin, S. Morariu, V. Bennevault-Celton, P. Guégan
- Aust. J. Chem., 65(8), 1145-1155, 2012

40. Photocontrol of the translocation of molecules, peptides, and quantum dots through cell and lipid membranes doped with azobenzene copolymers.
- S.C. Sebai, D. Milioni, A. Walrant, I.D. Alves, S. Sagan, C. Huin, L. Auvray, D. Massotte, S. Cribier, C. Tribet
- Angew. Chem. Int. Edit., 51(9), 2132-2136, 2012

41. Wild type, mutant protein unfolding and phase transition detected by single-nanopore recording.
- C. Merstorf, B. Cressiot, M. Pastoriza-Gallego, A.G. Oukhaled, J.-M. Betton, L. Auvray, J. Pelta
- ACS Chem. Biol., 7(4), 652-658, 2012

42. Thermal unfolding of proteins probed at the single molecule level using nanopores.
- L. Payet, M. Martinho, M. Pastoriza-Gallego, J.-M. Betton, L. Auvray, J. Pelta, J. Mathé
- Anal. Chem., 84(9), 4071-4076, 2012

43. Transport of long neutral polymers in the semidilute regime through a protein nanopore.
- A.G. Oukhaled, A.-L. Biance, J. Pelta, L. Auvray, L. Bacri
- Phys. Rev. Lett., 108(8), 088104, 22 2012

44. The richness of the eye of a needle. Comment on "Nanopores : a journey towards DNA sequencing".
- J. Mathé
- Phys. Life Rev., 9(2), 159-160, 2012

45. Protein transport through a narrow solid-state nanopore at high voltage : Experiments and theory.
- B. Cressiot, A. Oukhaled, G. Patriarche, M. Pastoriza, J.-M. Betton, L. Auvray, M. Muthukumar, L. Bacri, J. Pelta
- ACS Nano, 6(8), 6236-6243, 2012

46. Mapping the conformational stability of maltose binding protein at the residue scale using nuclear magnetic resonance hydrogen exchange experiments.
- C. Merstorf, O. Maciejak, J. Mathé, M. Pastoriza-Gallego, B. Thiebot, M.J. Clément, J. Pelta, L. Auvray, P. Curmi, P. Savarin
- Biochemistry, 61(44), 891-930, 2012

47. FIB carving of nanopores into suspended graphene films.
- A. Morin, D. Lucot, A. Ouerghi, G. Patriarche, A. Bourhis, Madouri, C. Ulysse, J. Pelta, L. Auvray, R. Jede, L. Bruchhaus, J. Gierak
- Microelectron. Eng., 97, 311-316, 2012

48. Sensing proteins through nanopores : Fundamental to applications.
- A. Oukhaled, L. Bacri, M. Pastoriza-Gallego, J.-M. Betton, J. Pelta
- ACS Chem. Biol., 7(12), 1935-1949, 2012

49. Nanohardness and brittleness of irradiated spinel ceramics.
- J. Jagielski, P. Aubert, O. Maciejak, A. Piatkowska, S. Labdi, I. Jozwik-Biala, P. Jozwik, A. Wajler
- Nucl. Instrum. Meth. B, 286, 196, 2012

Thèses :

- Synthèse et caractérisations de nouveaux polymères, à base de poly(éthylènimine), non toxiques et efficaces en thérapie génique
- Université d’Évry-Val-d’Essonne, 12 janvier 2012. Directeur de thèse : Philippe Guégan

- Influence de l’environnement sur l’altération de la matrice UO2 du combustible irradié en situation de stockage.
- Université d’Évry-Val-d’Essonne, 12 janvier 2012. Directeur de thèse : Annie Chaussé, co-encadrant : Nathalie Gruet

François BLIN
- Development of hybrid organic-inorganic polyrotaxanes and their modifications for biomedical ophthalmic applications.
- Université d’Évry-Val-d’Essonne, 13 janvier 2012. Directeurs de thèse : Hervé Cheradame et Nathalie Jarroux

- Synthèse et caractérisation de la birnessite électrodéposée : application à la dégradation du glyphosate.
- Université d’Évry-Val-d’Essonne, 5 mars 2012. Directeur de thèse : Annie Chaussé, co-encadrant : Sophie Peulon

- Synthèses et caractérisations des oxydes de manganèse déposés en couches minces par voie électrochimique : application à la dépollution des effluents industriels chargés en colorants organiques
- l’INSAT (Tunis) & Université d’Évry-Val-d’Essonne, 11 mai 2012. Annie Chaussé, co-encadrant : Sophie Peulon

- Role of tempering temperature on the hydrogen diffusion in a 34CrMo4 martensitic steel and the related embrittlement.
- Université d’Évry-Val-d’Essonne, 12 juillet 2012. Directeur de thèse : Jacques. Chêne

- Transport de protéines natives, partiellement et complètement dépliées à travers des nanopores protéiques et artificiels.
- Université d’Évry-Val-d’Essonne, Université de Cergy-Pontoise, 18 septembre 2012. Directeurs de thèse : Juan Pelta et Loïc Auvray

- Mécanismes d’absorption de l’hydrogène en milieu aqueux dans des aciers austénitiques Fe-Mn-C ; conséquences sur l’endommagement.
- Université d’Évry-Val-d’Essonne, 20 septembre 2012. Directeur de thèse : Jacques Chêne

Sandrine WAHU
- Synthèse et Evaluation des Propriétés Complexantes et Extractantes de Diamides Pour la Partition U(VI)/Pu(IV).
- UPMC, 27 septembre 2012. Directeur de thèse : G. Cote (ENSCP), encadrant CEA : Carole Bresson

Alexandre QUEMET
- Contribution à la compréhension des réactions ion-gaz dans la cellule de collision/réaction des ICP-MS : application à la résolution d’interférences isobariques et poly atomiques pour l’analyse des actinides et des produits de fission.
- Université d’Évry-Val-d’Essonne, 1er octobre 2012. Directeurs de thèse : Marie-Pierre Gaigeot (UEVE), R. Brennetot (CEA DEN)

Daniel ORTIZ
- Effects of metal complexation on heparin-like disaccharides : a combined experimental and theoretical approach.
- Université d’Évry-Val-d’Essonne, 29 novembre 2012. Directeur de thèse : Jean-Yves Salpin