http://www.lambe.univ-evry.fr http://www.cnrs.fr http://www.cnrs.fr/chimie/ http://www.cnrs.fr/edd/ http://www.cnrs.fr http://www.univ-evry.fr http://www.cea.fr http://www.genopole.org
Le CNRS
 




Rechercher

Sur ce site

Sur le Web du CNRS


Accueil du site > Production scientifique > Publications et thèses de 2014

Publications et thèses de 2014

Publications :

1. Structure of the Pb2+-deprotonated dGMP complex in the gas phase : a combined MS-MS/IRMPD spectroscopy/ion mobility study.
- J.-Y. Salpin, L. MacAleese, F. Chirot, P. Dugourd
- Phys. Chem. Chem. Phys., 16(27), 14127-14138, 2014
- DOI : 10.1039/c4cp00163j

2. Galactose-6-Sulfate collision induced dissociation using QM plus MM chemical dynamics simulations and ESI-MS/MS experiments.
- D. Ortiz, J.-Y. Salpin, K. Song, R. Spezia
- Int. J. Mass Spectrom., 358, 25-35, 2014
- DOI : 10.1016/j.ijms.2013.11.002

3. Gas-phase interactions between Lead(II) ions and Cytosine as probed by MS/MS and IRMPD spectroscopy.
- J.-Y. Salpin, V. Haldys, S. Guillaumont, J. Tortajada, M. Hurtado, A.M. Lamsabhi
- ChemPhysChem, 15, 2959-2971 (2014)
- DOI : 10.1002/cphc.201402369

4. Derivatization strategies for CE-LIF analysis of biomarkers : Toward a clinical diagnostic of familial transthyretin amyloidosis.
- S. Korchane, A. Pallandre, C. Przybylski, C. Pous, F. Gonnet, M. Taverna, R. Daniel, I. Le Potier
- Electrophoresis, 35(7, SI), 1050-1059, 2014
- DOI : 10.1002/elps.201300426

5. Identification of novel PAMP-triggered phosphorylation and dephosphorylation events in Arabidopsis thaliana by quantitative phosphoproteomic analysis.
- N. Rayapuram, L. Bonhomme, J. Bigeard, K. Haddadou, C. Przybylski, H. Hirt, D. Pflieger
- J. Proteome Res., 13(4), 2137-2151, 2014
- DOI : 10.1021/pr401268v

6. Synthetic oligomer analysis using atmospheric pressure photoionization mass spectrometry at different photon energies.
- B. Desmazières, V. Legros, A. Giuliani, W. Buchmann
- Anal. Chim. Acta, 808, 220-230, 2014
- DOI : 10.1016/j.aca.2013.11.036

7. The nano-bio interface mapped by oxidative footprinting of the adsorption sites of myoglobin.
- S. Devineau, C. Mathé, V. Legros, F. Gonnet, R. Daniel, J.-P. Renault, S. Pin
- Anal. Bioanal. Chem., in press, 2014
- DOI : 10.1007/s00216-014-8188-7

8. Hydration properties of lanthanoid(III) carbonate complexes in liquid water determined by polarizable molecular dynamics simulations.
- F. Martelli, Y. Jeanvoine, T. Vercouter, C. Beuchat, R. Vuilleumier, R. Spezia
- Phys. Chem. Chem. Phys., 16(8), 3693-3705, 2014
- DOI : 10.1039/c3cp54001d

9. Hydration properties of Cm(III) and Th(IV) combining coordination free energy profiles with electronic structure analysis.
- R. Spezia, Y. Jeanvoine, C. Beuchat, L. Gagliardi, R. Vuilleumier
- Phys. Chem. Chem. Phys., 16(12), 5824-5832, 2014
- DOI : 10.1039/c3cp54958e

10. The unique photophysical properties of the peridinin-chlorophyll-a-protein.
- D. Carbonera, M. Di Valentin, R. Spezia
- Curr. Protein Pept. Sc., 15(4), 332-350, 2014

11. Fermi Resonance as a tool for probing peridinin environment.
- E. Kish, M.M.M. Pinto, D. Bovi, M. Basire, L. Guidoni, R. Vuilleumier, B. Robert, R. Spezia, A. Mezzetti
- J. Phys. Chem. B, 118(22), 5873-5881, 2014
- DOI : 10.1021/jp501667t

12. Developing polarizable potential for molecular dynamics of Cm(III)-carbonate complexes in liquid water.
- R. Spezia, Y. Jeanvoine, R. Vuilleumier
- J. Mol. Model., 20(8), 2398, 2014
- DOI : 10.1007/s00894-014-2398-y

13. O-H anharmonic vibrational motions in Cl- … (CH3OH)1-2 ionic clusters. Combined IRPD experiments and AIMD simulations.
- J.P. Beck, A. Cimas, J. M. Lisy, M.-P. Gaigeot
- Spectrochim. Acta A, 119, 12-17, 2014
- doi.org/10.1016/j.saa.2013.05.073

14. High energy conformers of M+(APE)(H2O)(0-1)Ar0-1 clusters revealed by combined IR-PD and DFT-MD anharmonic vibrational spectroscopy.
- V. Brites, A.L. Nicely, N. Sieffert, M.-P. Gaigeot, J.M. Lisy
- Phys. Chem. Chem. Phys., 16(26), 13086-13095, 2014
- DOI : 10.1039/c4cp01275e

15. MDMC2 : A molecular dynamics code for investigating the fragmentation dynamics of multiply charged clusters.
- D.A. Bonhommeau, M.-P. Gaigeot
- Comput. Phys. Commun., 185(2), 684-694, 2014
- DOI : 10.1016/j.cpc.2013.10.015

16. Time-dependent density functional theory molecular dynamics simulation of doubly charged uracil in gas phase.
- P. Lopez-Tarifa, M.-A.H. du Penhoat, R. Vuilleumier, M.-P. Gaigeot, U. Rothlisberger, I. Tavernelli, A. Le Padellec, J.-P. Champeaux, M. Alcami, P. Moretto-Capelle, F. Martin, M.-F. Politis
- Cent. Eur. J. Phys., 12(2), 97-102, 2014
- DOI : 10.2478/s11534-014-0428-0

17. A RRKM study and a DFT assessment on gas-phase fragmentation of formamide-M2+ (M = Ca, Sr).
- A. Martin-Somer, M.-G. Gaigeot, M. Yanez, R. Spezia
- Phys. Chem. Chem. Phys., 16(28), 14813-14825, 2014
- DOI : 10.1039/c4cp01756k

18. MCMC2 (version 1.1) : A Monte Carlo code for multiply-charged clusters.
- D.A. Bonhommeau, M. Lewerenz, M.-P. Gaigeot
- Comput. Phys. Commun., 185(3), 1188-1191, 2014
- DOI : 10.1016/j.cpc.2013.09.026

19. Density functional theory across chemistry, physics and biology Introduction.
- T. van Mourik, M. Buhl, M.-P. Gaigeot
- Philos. T. R. Soc. A, 372(2011, SI), 20120488, 2014
- DOI : 10.1098/rsta.2012.0488

20. Gas-phase peptide structures unraveled by far-IR spectroscopy : Combining IR-UV ion-dip experiments with Born-Oppenheimer Molecular Dynamics Simulations.
- S. Jaeqx, J. Oomens, A. Cimas, M.-P. Gaigeot, A.M. Rijs
- Angew. Chemie. Int., 53(14), 3663-3666, 2014
- DOI : 10.1002/anie.201311189

21. Modeling proton-induced damage on 2-deoxy-D-ribose. Conformational analysis.
- M.A.H. du Penhoat, P. Lopez-Tarifa, K.K. Ghose, Y. Jeanvoine, M.-P. Gaigeot, R. Vuilleumier, M.-F. Politis, M.C. Bacchus-Montabonel
- J. Mol. Model., 20(5), 2221, 2014
- DOI : 10.1007/s00894-014-2221-9

22. Liquid-solid interfaces : structure and dynamics from spectroscopy and simulations. Preface.
- M.-P.Gaigeot, M. Sulpizi
- J. Phys.-Condens. Mat., 26(24), 240301, 2014
- DOI : 10.1088/0953-8984/26/24/240301

23. The amorphous silica-liquid water interface studied by ab initio molecular dynamics (AIMD) : local organization in global disorder.
- A. Cimas, F. Tielens, M. Sulpizi, M.-P. Gaigeot, D. Costa
- J. Phys.-Condens. Mat., 26(24), 244106, 2014
- DOI : 10.1088/0953-8984/26/24/244106

24. Ultrafast nonadiabatic fragmentation dynamics of biomolecules.
- P. Lopez-Tarifa, D.G. Piekarski, E. Rossich, M.-A.H. du Penhoat, R. Vuilleumier, M.-P. Gaigeot, I. Tavernelli, M.-F. Politis, Y. Wang, S. Diaz-Tendero, F. Martin, M. Alcami
- J. Phys. Conference Series, 488, 012037, 2014
- DOI : 10.1088/1742-6596/488/1/012037

25. Influence of GTP/GDP and magnesium ion on the solvated structure of the protein FtsZ : A Molecular Dynamics Study.
- C. Jamous, N. Basdevant, T. Ha-Duong
- J. Biomol. Struct. Dyn., 32(6), 916-927, 2014
- DOI : 10.1080/07391102.2013.799436

26.Perfect additivity of microinterface arrays for liquid-liquid measurements : Application to cadmium ions quantification.
- A. Mastouri, S. Peulon, D. Farcage, N. Bellakhal, A. Chaussé
- Electrochim. Acta, 120, 212-218, 2014
- DOI : 10.1016/j.electacta.2013.12.034

27. M(II) transfer across a liquid-liquid microinterface facilitated by a complex formation with 8-Hydroxyquinoline : Application to quantification of Pb(II), Cd(II) and Zn(II) alone or in mixture in effluents.
- A. Mastouri, S. Peulon, N. Bellakhal, A. Chaussé
- Electrochim. Acta, 130, 818-825, 2014
- DOI : 10.1016/j.electacta.2014.03.073

28. Performances of carbon-based screen-printed electrodes. modified by diazonium salts with various carboxylic functions for trace metal sensors.
- S. Bouden, N. Bellakhal, A. Chaussé, C. Vautrin-Ul
- Electrochem. Commun., 41, 68-71, 2014
- DOI : 10.1016/j.elecom.2014.01.028

29. Correlations between the grafting conditions and the copper detection by diazonium functionalized carbon screen-printed electrodes.
- S. Bouden, N. Bellakhal, A. Chausse, M. Dachraoui, C. Vautrin-Ul
- Electrochim. Acta, 125, 149-155, 2014
- DOI : 10.1016/j.electacta.2014.01.083

30. Fabrication and characterization of all-covalent nanocomposite functionalized screen-printed voltammetric sensors.
- J.-P. Jasmin, C. Cannizzo, E. Dumas, A. Chaussé
- Electrochimica Acta, 133, 467-474, 2014
- DOI : 10.1016/j.electacta.2014.04.069

31. Calix[6]arene mono-diazonium salt synthesis and covalent immobilization onto glassy carbon electrodes.
- C. Cannizzo, M. Wagner, J.-P. Jasmin, C. Vautrin-Ul, D. Doizi, C. Lamouroux, A. Chausse
- Tetrahedron Lett., 55(31), 4315-4318, 2014
- DOI : 10.1016/j.tetlet.2014.06.043

32. Dynamic aggregation of the mid-sized gadolinium complex Ph-4[Gd(DTTA)(H2O)(2)](-)(3)
- H. Jaccard, P. Mieville, C. Cannizzo, C.R. Mayer, L. Helm
- J. Biol. Inorg. Chem., 19(2), 145-159, 2014
- DOI : 10.1007/s00775-013-1036-y

33. Ultrasensitive QRS made by supramolecular assembly of functionalized cyclodextrins and graphene for the detection of lung cancer VOC biomarkers.
- S. Nag, L. Duarte, E. Bertrand, V. Celton, M. Castro, V. Choudhary, P. Guégan, J.-F. Feller
- J. Mater. Chem. B, 2(38), Pages : 6571-6579, 2014
- DOI : 10.1039/c4tb01041

34. Lipopolyplexes comprising imidazolefimidazolium lipophosphoramidate, histidinylated polyethyleneimine and siRNA as efficient formulation for siRNA transfection.
- C. Goncalves, M. Berchel, M.-P. Gosselin, V. Malard, H. Cheradame, P.-A. Jaffres, P. Guégan, C. Pichon, P. Midoux
- Int. J. Pharmaceut., 460(1-2), 264-272, 2014
- DOI : 10.1016/j.ijpharm.2013.11.005

35. Paper strengthening by polyaminoalkylalkoxysilane copolymer networks applied by spray or immersion : a model study.
- C. Piovesan, A.-L Dupont, I. Fabre-Francke, O. Fichet, B. Lavedrine, H. Cheradame
- Cellulose, 21(1), 705-715, 2014
- DOI : 10.1007/s10570-013-0151-9

36. Degradation of polyurethane ester foam artifacts : Chemical properties, mechanical properties and comparison between accelerated and natural degradation.
- E. Pellizzi, A. Lattuati-Derieux, B. Lavedrine, H. Cheradame
- Polym. Degrad. Stab., 107(SI), 255-261, 2014
- DOI : 10.1016/j.polymdegradstab.2013.12.018

37. Influence of pDNA availability on transfection efficiency of polyplexes in non-proliferative cells.
- B. Maury, C. Goncalves, G. Tresset, M. Zeghal, H. Cheradame, P. Guegan, C. Pichon, P. Midoux
- Biomaterials, 35(22), 5977-5985, 2014
- DOI : 10.1016/j.biomaterials.2014.04.007

38. Peptides and proteins view by nanopores : experiments, simulations and theory.
- J. Pelta
- Protein Peptide Lett., 21(3), 201-201, 2014

39. Protein unfolding through nanopores.
- A. Oukhaled, M. Pastoriza-Gallego, L. Bacri, J. Mathe, L. Auvray, J. Pelta
- Protein Peptide Lett., 21(3), 266-274, 2014

40. Flow injection of DNA in nanopores : direct optical visualization of a pressure threshold.
- T. Auger, J. Mathé, V. Viasnoff, J.-M. di Meglio, L. Auvray, F. Montel
- Biophys. J., 106(2-supplement 1), 211A-211A, 2014

41. Zero-mode waveguide detection of flow-driven DNA translocation through nanopores.
- T. Auger, M. Mathé, V. Viasnoff, G. Charron, J.-M. Di Meglio, L. Auvray, F. Montel
- Phys. Rev. Lett., 113(2), 028302, 2014
- DOI : 10.1103/PhysRevLett.113.028302

42. Unexpected membrane dynamics unveiled by membrane nanotube extrusion.
- C. Campillo, P. Sens, D. Koster, L.-L. Pontani, D. Levy, P. Bassereau, P. Nassoy, C. Sykes
- Biophys. J., 104(6), 1248-1256, 2014
- DOI : 10.1016/j.bpj.2013.01.051

Thèses :

Lisday DUARTE
- Synthèses et application de polymères à base de cyclodextrine et/ou D18:1.
- Université d’Évry-Val-d’Essonne, 9 janvier 2014
- Directeur de thèse : Philippe Guégan

Elodie TARNAUD
- Synthèse de vecteurs polymères pour la thérapie génique et construction de polyplexes par extrusion moléculaire.
- Université d’Évry-Val-d’Essonne, 15 janvier 2014
- Directeur de thèse : Philippe Guégan

Cédric PRZYBYLSKI
- Développement de nouvelles méthodes d’analyse d’oligosaccharides anioniques bioactifs par spectrométrie de masse.
- Université d’Évry-Val-d’Essonne, 11 février 2014
- Directeur de thèse : Régis Daniel, co-directrice : Florence Gonnet

Afef MASTOURI
- Développement de capteurs électrochimiques basés sur l’étude des transferts d’espèces à des micro-interfaces liquide | liquide pour la détection de polluants toxiques.
- l’INSAT (Tunis) & Université d’Évry-Val-d’Essonne, 26 juin 2014
- Directeur de thèse : Annie Chaussé, co-encadrant : Sophie Peulon

Julien PARRA
- Sulfoprotéomique : Développement analytique et rôle dans les processus d’interactions protéine/protéine.
- Université d’Évry-Val-d’Essonne, 11 septembre 2014
- Directrice de thèse : Florence Gonnet, co-directeur : Régis Daniel

Sarra BOUDEN
- Fonctionnalisation et caractérisation d’électrodes sérigraphiées pour la détection d’éléments-traces métalliques.
- l’INSAT (Tunis) & Université d’Évry-Val-d’Essonne, 26 septembre 2014
- Directrice de thèse : Annie Chaussé, co-encadrante : Christine Vautrin-Ul

Anna MLYNARCZYK
- Solution state structure of the human complement C3b- Factor H complex probed by Synchrotron X-ray footprinting-Mass Spectrometry.
- Université d’Évry-Val-d’Essonne, 20 novembre 2014
- Directeur de thèse : Régis Daniel, co-directrice : Florence Gonnet