SANA BOUGUEROUA

SANA BOUGUEROUA

Poste Actuel 

Ingénieur de Recherche (Experte en calculs scientifiques) LAMBE-UMR8587

    Missions

    • Développement et optimisation de codes de calculs scientifiques utilisés et développés dans le groupe Théorie et Modélisation du LAMBE.
    • Conception des méthodes basées sur l'expertise en informatique et en mathématiques (en particulier la théorie des graphes) pour la modélisation, le calcul et la visualisation des résultats des simulations de dynamiques moléculaires.
    • Gestion et administration du parc informatique du laboratoire LAMBE (sécurité́ informatique, sauvegarde pérenne des données,...)
    • Gestion du site web et de la collection HAL du LAMBE.

    Parcours acadimique

    • 2014-2017. Laboratoire DAVID, université de Paris Saclay, université de Versailles-St Quentin,France.
      Doctorat, spécialité: informatique (chimo-informatique).
      Intitulé: Caractérisation de structures explorées dans les simulations de dynamique moléculaire.
    • 2013 – 2014. Université Paris Est Marne La Vallée, France.
      Master international Bézout, spécialité: Algorithme, Bioinformatique et Combinatoire (ABC).
      Mémoire: Algorithmique de graphes pour l’analyse de trajectoires d’évolution des structures moléculaires, à l'université de Versailles-St Quentin.
    • 2008 – 2013. Ecole nationale Supérieure d'Informatique (ESI ex INI), Algérie.
      Ingénieur d’état en Informatique, spécialité: Systèmes Informatiques (SIQ).
      Mémoire: PostGWAS KnowledgeMiner: Une ressource bioinformatique intégrative et un paquetage R pour l'annotation, prédiction fonctionnelle et interprétation des données génomiques.

    Collaboration scientifique au sein du LAMBE

    • Application de la théorie des graphes pour l’analyse et la caractérisation des systèmes moléculaires en phase gazeuse (peptides) et en phase condensée (interfaces liquide-liquide, liquide-solide).
    • Développement des outils d’analyse des trajectoires [3]

    Collaboration scientifique internationale

    • Collaboration avec une équipe de l’Université de Amsterdam aux Pays-Bas pour l’application de méthodes de théorie des graphes sur des clutsters pour la catalyse
    1. Barth, D.; Bougueroua, S.; Gaigeot, M.-P.; Quessette, F.; Spezia, R.; and Vial, S. A new graph algorithm for the analysis of conformational dynamics of molecules. In Information Sciences and Systems 2015, pages 319–326. Springer (2016).
      DOI:10.1007/978-3-319-22635429
    2. Serva A, Pezzotti S, Bougueroua S, Galimberti DR, Gaigeot M-P. Journal of Molecular Structure (2018).
      DOI: 10.1016/201803074
    3. Interface web pour l’analyse des trajectoires : http://hydrochronographe.prism.uvsq.fr 
    4. Bougueroua, S.; Barth, D.; Quessette, F.; Spezia, R.; Vial, S.; and Gaigeot, M.-P. Graph theory for automatic structural recognition in molecular dynamics simulations. J. Chem. Phys. (2018).
      DOI: 10.1063/1.5045818
    5. D. Ruth Galimberti, S. Bougueroua, J. Mahé, M. Tommasini, A. M. Rijs, and M.-P. Gaigeot. Conformational assignment of gas phase peptides and their H-Bonded complexes using far-IR/THz: IR-UV ion dip experiment, DFT-MD spectroscopy, and Graph Theory for modes assignment. Faraday Discussions ‘Advances in Ion Spectroscopy’ (2019).
      DOI:10.1039/C8FD00211H
    6. Enhanced conductivity of water at the electrified air–water interface: a DFT-MD characterization. F. Creazzo, S. Pezzotti, S. Bougueroua, A. Serva, J. Sponer, F. Saija, G. Cassone, M-P. Gaigeot. Physical Chemistry Chemical Physics (2020).
      DOI: 10.1039/C9CP06970D
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